Una nueva investigación ofrece una matriz de SNP validada para camarones tigre negro y localiza con precisión el locus que determina el sexo. Respaldado por contribuciones de CSIRO y Genics, líder en detección de patógenos acuáticos y análisis genómico, este trabajo revela herramientas genómicas prácticas para acelerar la domesticación y la reproducción selectiva en camarones tigre negro (Penaeus monodon). Los hallazgos proporcionan un camino claro para que los productores fortalezcan el manejo de los reproductores, aceleren la ganancia genética y apoyen la producción confiable de la especie en todo el Indo-Pacífico.

Después de analizar los genomas de las poblaciones cultivadas y silvestres, los investigadores australianos diseñaron un panel denso y espaciado uniformemente de marcadores de ADN (SNP) informativos adaptados a Penaeus monodon. Las pruebas de rendimiento mostraron resultados sólidos y consistencia en todas las poblaciones, lo que demuestra que el panel es apto para el uso rutinario tanto en la agricultura comercial como en la investigación. En términos prácticos, esto les da a los programas de cría una visión clara de cómo se relacionan los animales y cuánta variedad genética tienen. El panel permite a los programas de mejoramiento rastrear la diversidad genética, controlar la endogamia y realizar selecciones basadas en datos para el crecimiento, la supervivencia y la resiliencia, piedras angulares de una domesticación y producción confiables.

Los investigadores también mapearon el marcador genético del sexo en un intervalo discreto en un cromosoma, aclarando la incertidumbre de larga data sobre los patrones de herencia en el camarón tigre negro. Este resultado proporciona un manejo práctico para los programas de mejoramiento: la capacidad de conocer el sexo genético, reducir la endogamia no intencional e informar estrategias donde las diferencias de rendimiento relacionadas con el sexo pueden ser relevantes para la producción. Combinada con la nueva matriz de SNP, esta investigación brinda a los productores palancas más precisas para alinear la planificación de reproductores con los objetivos comerciales.

«Poner en manos de los productores una herramienta de genotipado informativa validada y específica para cada especie marca un verdadero punto de inflexión para P. monodon«, dijo la Dra. Melony Sellars, fundadora y directora ejecutiva de Genics.

«Durante años, las ambiciones de reproducción se han visto limitadas por el acceso inconsistente a los reproductores silvestres y la visibilidad limitada de la genética subyacente. Esta investigación cambia esa ecuación y permite a los agricultores comerciales de todo el mundo cuantificar la diversidad, gestionar el riesgo y acelerar la ganancia genética de una manera controlada y sostenible».

Según el Dr. Ralf Moser, coautor y director científico de Genics, el énfasis estuvo en la utilidad práctica desde el primer día. «Nos propusimos construir un panel que funcione en múltiples linajes y contextos acuícolas, no solo en una sola población de referencia. El resultado es un conjunto de marcadores validados que los mejoradores pueden usar de inmediato, ya sea que el objetivo sea verificar la diversidad, guiar la asignación de parejas o sentar las bases para la selección genómica».

Para los productores, las aplicaciones inmediatas son claras. Los criaderos pueden implementar genotipado para informar planes de apareamiento que mantengan la diversidad mientras impulsan mejoras específicas. Las operaciones de engorde pueden comenzar a vincular los datos de rendimiento con los perfiles genómicos, preparando el terreno para la selección de rasgos que importan a escala de granja. Es importante destacar que para las cadenas de suministro del Indo-Pacífico, estas capacidades respaldan una transición gradual de la dependencia de los reproductores de captura silvestre hacia una producción predecible y biosegura.

Este nuevo recurso encaja con los servicios de genómica aplicada existentes de Genics para la industria de P. vannamei (camarón blanco del Pacífico). ShrimpID es utilizado por programas de cría a nivel mundial y admite la verificación del parentesco, el análisis de parentesco y la asignación informada de parejas, capacidades que complementan los avances de la investigación y ayudan a traducirlos en decisiones diarias. A medida que se acumulan los conjuntos de datos, los productores se centran en subconjuntos de marcadores rentables para la detección de rutina, al tiempo que conservan la precisión en las estimaciones de parentesco y los índices de selección.

«Se trata de brindar a los productores herramientas que funcionen en el mundo real», agregó el Dr. Moser. «Nuestros paneles genómicos son informativos en diferentes poblaciones y geografías, y son lo suficientemente flexibles como para adaptarse a aplicaciones de menor densidad a medida que los programas escalan».

El Dr. Sellars está de acuerdo: «Cuando puedes ver la genética con claridad, puedes planificar con claridad. Así es como el sector pasa del potencial al rendimiento, con una gestión más sólida de los reproductores, una mejora más rápida y resultados más consistentes en la granja».

El servicio ShrimpID P. monodon de Genicsaprovecha este panel de marcadores SNP de alta densidad para evaluar con precisión la diversidad genética y el linaje de trazas, proporcionando a los productores de camarones información vital para informar los programas de cría y optimizar el rendimiento de las poblaciones, lo que respalda aún más la misión de Genics de promover la bioseguridad y la seguridad alimentaria a nivel mundial.